Hva er DNA strekkoding
DNA barcoding, eller DNA-strekkoding på norsk, er en ny metode for artsbestemmelse som er tatt i bruk av biologier verden over. Dette har vært nødvendig for å øke presisjonsnivået og hastigheten på beskrivelsen av nye arter.
Begrepet strekkoding henspiller på strekkodene som brukes i dagligvarehandelen, for maskinell avlesning av prisen på en vare. Alle strekkoder har en unik kombinasjon av tjukke og tynne streker.
På samme måte som strekkodene i butikken identifiserer varen vil de fire byggesteinene i DNA molekylet A (Adenin), C (Cytosin), G (Guanin) og T (Tymin) i ulike kombinasjoner kunne brukes til å identifisere hver enkelt art på jorda. |
|
DNA-strekkoding er en kartlegging av ett spesielt gen hos alle arter innenfor samme organismegruppe. Hos dyr har man valgt genet CO1, som finnes i cellenes mitokondrier. Etter at artens unike strekkode er funnet lastes denne opp til et internasjonalt referansebibliotek som har fått navnet The Barcode of Life Data Systems (BOLD).
Et internasjonalt samarbeid
DNA barcoding er et bredt internasjonalt samarbeid bestående av 150 organisasjoner fra 45 land, som har forpliktet seg til å samle DNA-strekkoder fra så mange arter som mulig verden over. Strekkodene utgjør et referansebibliotek av DNA-materiale for fremtidig bestemmelse av arter.
Etter fem års arbeid har dette internasjonale nettverket av forskere strekkodet 67 000 arter, eller i underkant av fire prosent av jordas kjente biologiske mangfold. I oktober 2010 går startskuddet for International Barcoding of Life (iBOL), som er en internasjonal storsatsning med 26 deltakernasjoner og med konkrete mål om å identifisere en halv million arter i løpet av de neste fem årene.
Norge har en viktig rolle
Norwegian Barcode of Life (NorBOL) er et nettverk av norske forskere og forskningsinstitusjoner som bidrar til det pågående internasjonale samarbeidet, gjennom å lage et referansebibliotek av standardiserte DNA-sekvenser fra norske arter. NorBOL har også et spesielt ansvar for å bidra internasjonalt med DNA-strekkoding av arktiske arter, og er såkalt regional node i det internasjonale samarbeidet.
Hittil har NorBOL strekkodet alle norske fuglearter og arbeider videre med de andre gruppene av vertebrater. Det arbeides også aktivt med insektgrupper som fjærmygg, sommerfugl og veps. Etter hvert vil arbeidet innrettes spesielt mot taksonomiske grupper som er dårlig undersøkt, i tråd med Artsprosjektets målsetninger, og også planter og sopp vil inngå i strekkodingen.
Artsprosjektet muliggjør norsk deltakelse
Artsprosjektet vil i 2010 støtte arbeidet til NorBOL for å sikre at det etableres gode rutiner for DNA-strekkoding av materialer som samles inn gjennom Artsprosjektets kartleggingsprosjekter. Slik ønsker Artsprosjektet å løfte den norske delen av det internasjonale prosjektet, og å bidra til at det opprettes et DNA-strekkode arkiv over norske arter etter internasjonal standard.
Konkret innebærer Artsprosjektets støtte at NorBOL sørger for at referansematerialer innsamlet i regi av Artsprosjektet ivaretas for videre DNA-analyser, og at en stor del av materialet sendes til sekvensering. Arbeidet inkluderer kvalitetssikring av referansematerialer fra Artsprosjektet gjennom taksonomisk bestemmelse, håndtering av typeeksemplarer og sekvensering av DNA-prøver.
Videre skal NorBOL koordinere DNA-sekvenseringen mot arbeidet som gjøres internasjonalt, og forvalte dataene som kommer ut av prosjektet i iBOLs database BOLD, i Artskart og i GBIF.
Det økonomiske bidraget fra Artsprosjektet er avgjørende for NorBOLs aktivitet i 2010, og dermed også for at Norge kan bidra til og delta i det internasjonale arbeidet som nå igangsettes av iBOL. Norges forskningsråd har også ført opp NorBOL som ett av de 17 prosjekter på Norsk veikart for forsknings-infrastruktur 2010, som ble lansert 21. juni 2010.
Aktuell dokumentasjon:
Kontaktperson:
|
Ingrid Salvesen
E-post: Ingrid.Salvesen@artsdatabanken.no
Telefon: 73 59 22 13
Mobil: 48 29 04 32 |